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西南大學(xué) - 話題

微生物學(xué)專業(yè)培養(yǎng)方案

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西南大學(xué)

碩士研究生培養(yǎng)方案

一級學(xué)科名稱

生物學(xué)

專
業(yè)
名
稱

微生物學(xué)

專
業(yè)
代
碼

071005

一、學(xué)科（專業(yè)）主要研究方向

序號

研究方向名稱

主要研究內(nèi)容、特色與意義

研究生導(dǎo)師

(博導(dǎo)注明)

微生物基因工程

利用一定的技術(shù)將目標(biāo)基因?qū)胛⑸镏校芯科鋵χ亟M菌株性狀的影響。利用該方法可以進(jìn)行基因功能分析及獲得所需性狀的重組菌株。

農(nóng)用抗生素及生防微生物

研究微生物次生代謝產(chǎn)物對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)影響，生防微生物的基礎(chǔ)研究及開發(fā)。為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)提供更為安全、可靠的生物農(nóng)藥，并減少對環(huán)境的污染。

藥物微生物功能基因組學(xué)與新型藥物篩選

圍繞藥用微生物的功能基因組研究，篩選藥物作用靶標(biāo)，構(gòu)建新的化合物庫，開展藥物相關(guān)的研究與開發(fā)。

微生物與植物營養(yǎng)

研究菌根與菌劑、根際微生物、微生物與植物營養(yǎng)的關(guān)系。

微生物分子生化與次生代謝

主要研究微生物參與不同生物化學(xué)及次生代謝途徑的基因簇，通過對這些基因的克隆分析，確定關(guān)鍵基因，進(jìn)而提高整套基因共同作用產(chǎn)物的生物學(xué)效能。

食品微生物

研究與食品有關(guān)的微生物的生物學(xué)特性，利用有益微生物發(fā)酵生產(chǎn)食品，對有害微生物進(jìn)行控制，保證食品的安全性，保障人民健康。

微生物基因組學(xué)

主要采用功能基因組學(xué)的研究方法，對人類健康、工農(nóng)業(yè)等具有重要影響的微生物進(jìn)行整體性研究，獲得對這類微生物全景式認(rèn)識。

動物微生物學(xué)

主要開展動物微生物的分離鑒定和生物學(xué)特性、功能基因的克隆與工程菌株的構(gòu)建、微生物酶制劑、微生態(tài)制劑、微生物源抗菌抗病毒活性物質(zhì)等研究，為飼料工業(yè)和動物安全生產(chǎn)提供優(yōu)良菌株和微生物源制劑。

藥物微生物功能基因組學(xué)與新型藥物篩選

圍繞藥用微生物的功能基因組研究，篩選藥物作用靶標(biāo)，構(gòu)建新的化合物庫，開展藥物相關(guān)的研究與開發(fā)。

二、培養(yǎng)目標(biāo)與學(xué)制及應(yīng)修學(xué)分

  培養(yǎng)目標(biāo)（本表可不填政治標(biāo)準(zhǔn)）：


  掌握本學(xué)科堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)理論、系統(tǒng)的專門知識和相應(yīng)的技能方法，掌握一門外國語和能熟練使用計算機(jī)，具有從事科研、教學(xué)和管理工作的能力。
  身心健康。

  學(xué)制：全日制學(xué)術(shù)型碩士生2~5年，基本學(xué)習(xí)年限為3年。
  應(yīng)修學(xué)分： 33學(xué)分（各學(xué)科自定）
  其中
必修：23
學(xué)分（含必修環(huán)節(jié)4學(xué)分）
  選修不低于：10
學(xué)分

三、課程設(shè)置（包括主文獻(xiàn)研讀、學(xué)術(shù)活動等必修環(huán)節(jié)）

類型

課程編號

課程名稱（含中英文）

開課學(xué)期

學(xué)時

學(xué)分

任課

教師

考核

方式

備注

必修課

公共課

11000001001

第一外國語

外國語學(xué)院

考試

11000002002

中國特色社會主義理論與實(shí)踐研究

馬克思主義學(xué)院

考試

11000002003

自然辯證法概論

馬克思主義學(xué)院

考試

平臺課

11071005011

高級微生物學(xué)

周澤揚(yáng)等

考試

專業(yè)課

11071005020

中外主文獻(xiàn)研讀

導(dǎo)師組

考試

11071005021

微生物研究進(jìn)展

周澤揚(yáng)等

考試

11071010022

分子生物學(xué)

羅小英，柴友榮，劉堰等

考試

11071005023

研究生班討論

導(dǎo)師組

考試

選

修

課

11071005065

基因表達(dá)技術(shù)

范艷華

考查

11090102055

高級生物化學(xué)

李關(guān)榮等

考查

11090102011

分子遺傳學(xué)

何鳳華，謝建平等

考查

11071005053

菌根生物學(xué)

黃建國

考查

11071005054

動物病原微生物

彭遠(yuǎn)義

考查

11083200011

食品微生物學(xué)進(jìn)展

杜小兵

考查

11071005056

微生物分類學(xué)

黃建國等

考查

11071009021

細(xì)胞生物學(xué)

李名揚(yáng)等

考查

11071005058

食品微生物學(xué)與酶工程

賀稚非

考查

11071005059

土壤與環(huán)境微生物學(xué)

張磊

考查

11071005060

生物防治微生物學(xué)

裴炎等

考查

11071005061

分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)原理與技術(shù)

裴炎等

考查

11071005062

現(xiàn)代微生物學(xué)研究技術(shù)

導(dǎo)師組

考查

11100705021

微生物藥物學(xué)

謝建平

考查

11071005064

微生物遺傳學(xué)

廖宇靜

考查

11000000040

計算機(jī)應(yīng)用基礎(chǔ)

研究生院

考查

其它必修環(huán)節(jié)

開題報告

不計學(xué)分，完清審核簽字手續(xù)，向培養(yǎng)單位提交開題報告一份

學(xué)術(shù)活動：參加學(xué)術(shù)報告、前沿講座、學(xué)術(shù)研討等（至少5次）

提交學(xué)術(shù)報告手冊，導(dǎo)師簽字，培養(yǎng)單位核查

實(shí)踐活動：社會、教學(xué)和科研實(shí)踐活動(三選一)

導(dǎo)師審查簽字后向培養(yǎng)單位提交實(shí)踐報告一份或發(fā)表高水平論文的復(fù)印件

中期考核及論文進(jìn)展檢查

不計學(xué)分，完清審核簽字手續(xù)，向培養(yǎng)單位提交相關(guān)材料各一份

同等學(xué)力補(bǔ)修課程

基礎(chǔ)生物化學(xué)

不計學(xué)分

基礎(chǔ)微生物學(xué)

不計學(xué)分

細(xì)胞生物學(xué)

不計學(xué)分

注：1．平臺課是指涵蓋本一級學(xué)科下所有二級學(xué)科或相近二級學(xué)科群共有的基礎(chǔ)性課程，可根據(jù)實(shí)際情況開設(shè)。
2．按一級學(xué)科制定培養(yǎng)方案者應(yīng)在專業(yè)必修課備注欄內(nèi)標(biāo)明所屬二級學(xué)科。
3．必修環(huán)節(jié)在研究生畢業(yè)前必須完成，構(gòu)成答辯的必備條件。

四、培養(yǎng)方式與方法

  培養(yǎng)流程與要求，檢查與考核，質(zhì)量監(jiān)督等措施：
  碩士生采取課程學(xué)習(xí)與論文并重的原則，用于學(xué)位論文研究時間不得少于1年。
  １．制定培養(yǎng)計劃
  第一學(xué)期內(nèi)在導(dǎo)師或?qū)熃M的指導(dǎo)下制定“碩士生個人培養(yǎng)計劃”一式兩份，一份由研究生自己保存，一份報所在培養(yǎng)單位備案。
  ２．主文獻(xiàn)研讀
  在開題報告前認(rèn)真研讀本學(xué)科專業(yè)主文獻(xiàn)，填寫主文獻(xiàn)閱讀報告記錄，提交導(dǎo)師審核。
  ３．開題報告
  開題報告是學(xué)位論文研究的一個重要環(huán)節(jié)。碩士生學(xué)位論文開題時間放在第三學(xué)期或第四學(xué)期初，可與中期考核同時進(jìn)行。培養(yǎng)單位根據(jù)研究生選題情況，按二級學(xué)科成立若干開題報告審查小組。審查小組由具有研究生培養(yǎng)經(jīng)驗(yàn)、副高以上職稱的專家3-5人組成，對論文選題的可行性進(jìn)行論證，分析難點(diǎn)，明確方向，以保證學(xué)位論文按時完成并達(dá)到預(yù)期結(jié)果。
  ４．學(xué)術(shù)活動
  碩士生應(yīng)積極參加各種學(xué)術(shù)活動，如學(xué)術(shù)報告、前沿講座、學(xué)術(shù)研討等，在學(xué)習(xí)期間（一般在中期考核前）須參加學(xué)術(shù)活動不得少于5次。應(yīng)填寫“研究生參加學(xué)術(shù)活動記錄冊”，提交導(dǎo)師審查。
  ５．實(shí)踐活動
  實(shí)踐活動包括教學(xué)實(shí)踐、社會實(shí)踐和科研實(shí)踐，碩士研究生可任選其中一項(xiàng)實(shí)踐。在完成實(shí)踐活動后應(yīng)提交實(shí)踐報告一份或發(fā)表高水平論文的復(fù)印件，提交導(dǎo)師審查簽字。
  ６．中期考核
  根據(jù)本單位研究生規(guī)模和學(xué)科點(diǎn)現(xiàn)狀，按照學(xué)校研究生中期考核實(shí)施辦法提出本單位研究生中期考核工作的具體時間和辦法，中期考核一般安排在第四學(xué)期初進(jìn)行。
  A、考核在培養(yǎng)單位統(tǒng)一組織領(lǐng)導(dǎo)下，由各專業(yè)負(fù)責(zé)實(shí)施，組成包括培養(yǎng)單位（學(xué)科）負(fù)責(zé)人、導(dǎo)師代表、班主任等在內(nèi)的若干考核小組（每組成員3-5人）進(jìn)行考核，同時較廣泛地聽取其他教師的意見。
  B、業(yè)務(wù)方面主要考核研究生課程學(xué)習(xí)是否達(dá)到規(guī)定要求，通過課程學(xué)習(xí)反映出來的科研及思維能力；政治、思想、品德方面的考核由院學(xué)生工作組會同有關(guān)人員進(jìn)行。
  C、填寫“西南大學(xué)研究生中期考核自我評估表”，對被考核研究生作出結(jié)論性意見。
  D、經(jīng)過中期考核的碩士研究生，按考核結(jié)果分3種流向：
  a)
碩-博連讀：具體要求見學(xué)校相關(guān)文件規(guī)定。
  b)
進(jìn)入碩士論文階段：學(xué)習(xí)成績良好，具有一定研究工作能力（以論文為主要參照），可進(jìn)入碩士論文階段，繼續(xù)完成碩士學(xué)業(yè)。
  c)
中止學(xué)業(yè)：個別成績較差，明顯表現(xiàn)出缺乏科研能力，或因其他原因不宜繼續(xù)攻讀學(xué)位者，要求限期改正，限期未改正者中止其學(xué)業(yè)，按學(xué)籍管理的有關(guān)規(guī)定，發(fā)給相應(yīng)證書。
  7．學(xué)位論文中期進(jìn)展及檢查（列出時間、具體組織形式等）
  中期考核在入學(xué)后第四學(xué)期初進(jìn)行。具體考核方式按照《西南大學(xué)研究生中期考核實(shí)施辦法》（西校【2006】357號執(zhí)行）。具體考核方式如下：
  1、中期考核主要由“西南大學(xué)研究生院綜合管理信息系統(tǒng)（MIS）”自動進(jìn)行。凡課程學(xué)習(xí)及必修環(huán)節(jié)符合相應(yīng)學(xué)科專業(yè)培養(yǎng)方案要求且在  MIS內(nèi)提交完畢相關(guān)培養(yǎng)信息后， MIS將自動計算其考核綜合平均成績，綜合平均成績等級顯示為A（優(yōu)秀，成績績點(diǎn)為5）、B（良，成績績點(diǎn)為4）、C（合格，成績績點(diǎn)為3）、D（不合格，成績績點(diǎn)為3以下）。
  綜合平均成績是根據(jù)學(xué)生相對成績績點(diǎn)和學(xué)分計算的，綜合平均成績C=3.0（含3.0）以上的為合格，此時中期考核狀態(tài)顯示為
“通過”；綜合平均成績在3.0以下的為不合格，此時中期考核狀態(tài)顯示為
“未通過”。
  2、
學(xué)院、所、中心也可采取考核小組考核與MIS自動考核相結(jié)合的方式，考核小組主要就學(xué)生思想品德、科研能力及學(xué)位論文進(jìn)展情況進(jìn)行考核。
  3、
考核小組由所在院（所、
中心）負(fù)責(zé)研究生培養(yǎng)的領(lǐng)導(dǎo)、學(xué)科帶頭人、指導(dǎo)教師代表和研究生班主任等組成，主管研究生培養(yǎng)的領(lǐng)導(dǎo)或?qū)W科帶頭人任組長。考核小組至少由5人組成。
  4、
考核合格者繼續(xù)學(xué)習(xí)；不合格者要限期予以改正，限期未改正者予以陶汰。


  論文進(jìn)展檢查在入學(xué)后第四學(xué)期末進(jìn)行，由本學(xué)科和相關(guān)學(xué)科的5名教授組成檢查委員會，對碩士生進(jìn)行論文進(jìn)展檢查。檢查碩士生的研究工作進(jìn)度和質(zhì)量，對工作中存在的問題予以糾正。

五、科研能力與水平及畢業(yè)與畢業(yè)論文的基本要求

  科研能力與水平的基本要求（列出可證明其科研能力與水平的檢驗(yàn)標(biāo)志）：


  研究生應(yīng)在導(dǎo)師的指導(dǎo)下參加導(dǎo)師的課題研究，承擔(dān)一定的科研任務(wù)，培養(yǎng)獨(dú)立開展科學(xué)研究的能力；能熟練的查閱專業(yè)文獻(xiàn)資料，并進(jìn)行歸納總結(jié)。掌握本學(xué)科某一方向的發(fā)展趨勢，能應(yīng)用常規(guī)的實(shí)驗(yàn)方法進(jìn)行實(shí)驗(yàn)工作。完成論文期間，需要進(jìn)行開題報告和中期考核，并參加相應(yīng)的學(xué)術(shù)討論。

  畢業(yè)與畢業(yè)論文的基本要求（包括畢業(yè)條件、畢業(yè)論文等方面的要求）：
  畢業(yè)條件：
  在學(xué)校規(guī)定年限內(nèi)，按培養(yǎng)方案的規(guī)定完成課程學(xué)習(xí)、學(xué)分要求和必修環(huán)節(jié)，成績合格，完成畢業(yè)論文并通過答辯，經(jīng)審查合格者，準(zhǔn)予畢業(yè)。
  碩士研究生確因?qū)W業(yè)優(yōu)秀，經(jīng)本人申請，指導(dǎo)教師和所在培養(yǎng)單位同意，報研究生院批準(zhǔn)，可以申請?zhí)崆爱厴I(yè)，但在校時間不得少于二年。凡申請?zhí)崆爱厴I(yè)者，應(yīng)當(dāng)達(dá)到以下基本條件：
  1．中期考核結(jié)論為優(yōu)秀或在校期間被評為優(yōu)秀研究生；
  2．人文社會學(xué)科類在申請畢業(yè)答辯前公開發(fā)表屬于畢業(yè)論文研究組成部分的2篇A類學(xué)術(shù)論文，自然科學(xué)類在申請畢業(yè)答辯前公開發(fā)表屬于畢業(yè)論文研究組成部分的2篇A1學(xué)術(shù)論文。學(xué)術(shù)論文界定標(biāo)準(zhǔn)以學(xué)校最新發(fā)文公布為準(zhǔn)。
  畢業(yè)論文基本要求：
  畢業(yè)論文應(yīng)是一篇系統(tǒng)的、完整的、規(guī)范的學(xué)術(shù)論文，具體要求如下：
  1、
選題有學(xué)術(shù)和社會意義；
  2、
能反映出作者掌握了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)理論和系統(tǒng)的專門知識；
  3、
了解與論文相關(guān)的前沿研究動態(tài)；
  4、
研究主題明確、問題集中、論證嚴(yán)密可靠、有明顯的專業(yè)特色、有新見解。
  答辯要求：
  1.必須進(jìn)行畢業(yè)論文學(xué)術(shù)不端行為檢測;
  2.聘請2名具有副教授以上或相當(dāng)職稱的專家評閱;
  3.畢業(yè)答辯由5位及以上（單數(shù)）同行專家組成;
  4.答辯程序與學(xué)位論文答辯程序要求一致;
  5.論文編寫格式、排版要求等與學(xué)位論文相關(guān)要求一致。
  通過畢業(yè)論文答辯并向研究生院提交答辯材料（碩士研究生畢業(yè)論文2本、碩士研究生畢業(yè)申請書2份，論文評閱書各1份），經(jīng)審核合格者準(zhǔn)予畢業(yè)。
  僅獲得畢業(yè)證者，可在畢業(yè)后1年內(nèi)申請學(xué)位論文答辯，逾期學(xué)校不再受理學(xué)位申請。

六、學(xué)位論文的基本要求

  （包括學(xué)術(shù)水平、創(chuàng)造性成果及工作量等方面的要求）：
  資格要求：
  學(xué)術(shù)成果按照學(xué)校學(xué)位委員會有關(guān)規(guī)定執(zhí)行。成果無侵犯他人著作權(quán)行為，沒有發(fā)表有嚴(yán)重科學(xué)性錯誤的文章、著作和嚴(yán)重歪曲原作的譯作。
  內(nèi)容要求：
  對所研究的課題有新見解或新成果，對本學(xué)科發(fā)展或經(jīng)濟(jì)建設(shè)、社會進(jìn)步有一定意義；必須是一篇系統(tǒng)完整的、有創(chuàng)造性的學(xué)術(shù)論文；一般不應(yīng)少于3萬字；應(yīng)在導(dǎo)師指導(dǎo)下由碩士研究生本人獨(dú)立完成。
  技術(shù)規(guī)范要求：
  自己的研究結(jié)果與他人的觀點(diǎn)、材料、數(shù)據(jù)等不相混淆，引用他人的觀點(diǎn)、材料、數(shù)據(jù)等注明來源；獨(dú)立完成論文，在準(zhǔn)備和撰寫過程中接受導(dǎo)師指導(dǎo)、采納專家建議、獲得他人幫助等應(yīng)實(shí)事求是地表示感謝，但不能把未對論文提供幫助的名人等列入致謝之列；涉及到的背景知識、引用的資料和數(shù)據(jù)準(zhǔn)確無誤，所用概念、術(shù)語、符號、公式等符合學(xué)術(shù)規(guī)范，沒有嚴(yán)重錯誤或使用嚴(yán)重錯譯的譯文；對問題的論述完整、系統(tǒng)、邏輯嚴(yán)密，關(guān)鍵詞得當(dāng)；語言精練，語句符合現(xiàn)代漢語規(guī)范，錯別字、標(biāo)點(diǎn)符號錯誤、外文拼寫錯誤、筆誤和校對錯誤等總計不超過論文的萬分之三（按排版篇幅計）。
  按學(xué)校要求，在《學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明》和《學(xué)位論文版權(quán)協(xié)議書》上簽名，并附在學(xué)位論文首頁。
  具體格式按照《西南大學(xué)博士研究生、碩士研究生學(xué)位論文撰寫及打印要求》執(zhí)行。

七、主文獻(xiàn)研讀課程書目（列出本學(xué)科專業(yè)的必讀文獻(xiàn)，不夠可另附頁）

序號	著作或期刊的名稱	作者、出版單位及年月
1	Molecular structure of nucleic acids; a structure for deoxyribose nucleic acid	Watson, J. D. Crick, F. H. Nature, 1953,171(4356),737-738
2	Gene recombination in Escherichia coli	Lederberg, J. Tatum, E. L.,Nature, 1946,158(4016),558
3	The centenary of the one-gene one-enzyme hypothesis.	Hickman, M., and J. Cairns, Genetics, 2003，163: 839–841.
4	The gene (H. J. Muller 1947).	Lederberg, J., Genetics, 1991，129: 313–316.
5	RNA Dynamics in Aging Bacterial Spores	Einat Segev, Yoav Smith, Sigal Ben-YehudaSee, Cell, 2011,148(1): 139-149
6	DNA Polymerases Discovery, Characterization and Functions in Cellular DNA Transactions	Ulrich Hübscher (University of Zurich, Switzerland) Silvio Spadari (Institute of Molecular Genetics IGM-CNR, Italy) By (author): Giuseppe Villani (CNRS-UniversitéPaul Sabatier, Toulouse, France) By (author): Giovanni Maga (Institute of Molecular Genetics IGM-CNR, Italy), 340pp Apr 2010
7	Microbiology: A Centenary Perspective	ASM Press, 1999-604頁
8	Pioneers Of Microbiology And The Nobel Prize	Ulf Lagerkvist (Gothenburg University, Sweden), 188pp Jun 2003
9	Microbiology Fifth Edition	Lansing M. Prescott, et al., 2002
10	The Other End of the Microscope: the Bacteria Tell Their Own Story	Elmer Koneman，May 14 2002,218
11	Outbreak: Cases in Real-World Microbiology	Rodney P. Anderson, Ohio Northern University，May 2006，336
12	微生物生物學(xué)	M.T馬迪根等主編, 2001年出版

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